Apprenti(e) Concepteur/Développeur informatique bioinformatique F/H

Descriptif L'apprenti(e) participera à : . La conception, au développement et à l'évolution de pipelines d'analyse bioinformatique ; . L'intégration, l'automatisation et l'orchestration d'outils de traitement de données génomiques et transcriptomiques ; . La mise en oeuvre et l'évaluation de nouvelles méthodes d'analyse de variants génétiques et de données omiques ; . L'exploitation et l'interprétation technique de données issues de technologies variées : DNA-seq, RNA-seq, long reads, transcriptomique et autres jeux de données omiques ; . La structuration, la fiabilisation et la reproductibilité des traitements informatiques ; . Le développement de scripts, modules et outils facilitant le contrôle qualité, le post-traitement, . L'agrégation et la restitution de résultats ; . La documentation technique des développements réalisés ; . La veille technologique et méthodologique sur les outils et approches d'analyse en bioinformatique ; . La participation aux échanges avec les utilisateurs / biologistes / bioinformaticiens pour adapter les développements aux besoins des projets. Les travaux pourront porter sur : . Le développement de workflows reproductibles pour l'analyse de données de séquençage ; . L'évaluation comparative d'outils et de stratégies d'analyse ; . L'amélioration des performances, de la robustesse et de la traçabilité des pipelines ; . Le traitement et l'exploitation de données omiques issues de cohortes ou d'activités cliniques ; . La standardisation des sorties d'analyse et des indicateurs qualité ; . La contribution à des projets en lien avec les maladies rares, l'oncologie ou d'autres applications de génomique clinique et translationnelle. Diplôme : Étudiant(e) en Master bioinformatique, informatique, data science, génomique computationnelle ou domaine proche, recherchant un contrat d'apprentissage. Niveau d'étude : Préparant un master Niveau d'expérience : Pré-licence ou licence dans un domaine connexe (Bio-informatique, data science, génomique computationnel) Compétences : .Bon niveau en programmation, en particulier Python ; .Connaissance de l'environnement Linux / shell ; .Intérêt pour l'automatisation de traitements et les workflows ; .Appétence pour la gestion de données volumineuses ; .Intérêt pour la bioinformatique, la génomique et l'exploitation de données cliniques et biologiques ; .La connaissance d'outils ou concepts de type Git, Docker/containers, workflow managers, formats de données de séquençage constitue un plus. Prérequis : .Bon niveau en programmation, en particulier Python ; .Connaissance de l'environnement Linux / shell ; Savoir-faire et savoir être : .Rigueur et sens de l'organisation ; .Capacité d'analyse et de résolution de problèmes ; .Goût pour le développement et l'amélioration continue ; .Capacité à documenter son travail ; .Anglais niveau professionnel ; .Aptitude à travailler en équipe pluridisciplinaire. POUR CANDIDATER : MERCI DE CLIQUER SUR l'"URL de l'offre" CI-DESSOUS