Bio Informaticien En Recherche Developpeur Gestionnaire Pipelines Bioinformatiques (F./H.)

Descriptif Grade Grille de référence I.H. Type de contrat Contractuels acceptés Pourcentage d'activité 100% DÉFINITION : Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche ACTIVITÉS PRINCIPALES : Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique Gestion des versions de ces scripts. Développement des progiciels et programmation nécessaires à l'exploitation des données biologiques et médicales Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d'activité Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe Traitement et analyse de l'information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique Veille professionnelle ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE : Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales. Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique) CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) : Ingénieur hospitalier Catégorie A